سموم موجود در مواد غذایی و میکروب‌های بالقوه مضر مواد غذایی می‌توانند تاثیرات بدی بر روده‌های ما بگذارند و سبب برخی بیماری‌های جزئی شوند. افراد سالم هنگام ابتلا به چنین بیماری‌هایی به طور معمول در طی یک یا دو روز بهبود می‌یابند اما در افراد مبتلا به بیماری کرون اینگونه نیست و زخم‌ها چرک می‌کنند و باعث درد شکم، خونریزی، اسهال و سایر علائم ناخوشایند می‌شوند.